Un matí, Ran es desperta sobresaltada per un malson. En ella, a la seva mare Eri li peguen un tir. Ran no té ni idea del perquè d'aquest somni fins que recorda que 10 anys abans el seu pare Kogoro, quan encara estava en el cos de policia, va disparar a Eri com a única manera d'arrestar al criminal Jo Murakami.
Justament en aquests dies, Jo Murakami ha sortit de presó després de complir una condemna de 10 anys pels seus crims. Kogoro Mouri i Juuzo Megure van ser els seus captores. Una setmana després de recobrar la lliberteu Murakami, els coneguts de Kogoro estan sent objectiu d'un atacant desconegut. El primer és l'inspector Megure, que és arribat a per una fletxa mentre corre pel parc. Qui li ha disparat i què significa l'espasa que es troba al costat del lloc de succés? El segon atac té com víctima a Eri Kisaki, la dona de Kogoro encara que ja no visquin junts, que és enverinada amb bombons de xocolata. En la caixa de bombons apareix un flor de paper que a Kogoro li és estranyament familiar. El següent a caure és el professor Hiroshi Agase, arribat a també per una fletxa. L'objecte oposat permet que Conan comenci a destriar la veritat de tots els atacs que s'estan succeint. Assolirà parar-li els peus a Jo Murakami abans que continuï atacant als éssers volguts de Kogoro? I quina és la importància del tir d'en Kogoro a l'Eri de fa 10 anys?