Un temple de Tòquio. Tres homes que guarden un secret es reunen allí. De cop i volta, apareix un sinistre home amb una màscara Okina, una espasa japonesa i el seu arc, i els assassina. AL mateix temps, han assassinat a altre home en en Osaka i a Kyoto. El departament de policia treu la conclusió que els cinc homes morts eren membres de "Genjibotaru", un grup de lladres que havia robat nombrosos objectes i obres d'art en les ciutats de Tòquio, Kyoto i Osaka. Serà l'assassí algú que busca venjança? O serà a causa de un conflicte intern de la banda? El departament de policia es veu incapaç d'obtenir una pista ni conèixer el mòbil del crim. D'altra banda, Conan, que arriba A Kyoto amb Kogoro, Ran i Sonoko, s'uneix a Hattori Heiji para investigar el cas. No obstant això, els homes amb les màscares de Okina es creuen en el seu camí. En les cruïlles de Kyoto, Conan i els seus amics haurien d'enfrontar-se a homes misteris i a paranys ocults en la foscor. Un cas difícil amb amistats i relacions amoroses, i la intervenció de tots els personatges. I el cos de Conan per fi...